Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Borcs6Q9D6W8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Borcs6Q9D6W8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms