Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ptp4a3Q9D658 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ptp4a3Q9D658 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ptp4a3Q9D658 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ptp4a3Q9D658 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ptp4a3Q9D658 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ptp4a3Q9D658 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ptp4a3Q9D658 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ptp4a3Q9D658 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ptp4a3Q9D658 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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