Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms