Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed11Q9D2R4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms