Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms