Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms