Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms