Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mrpl20Q9CQL4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mrpl20Q9CQL4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mrpl20Q9CQL4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mrpl20Q9CQL4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Mrpl20Q9CQL4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mrpl20Q9CQL4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Mrpl20Q9CQL4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms