Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms