Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms