Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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