Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim3Q99PE5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim3Q99PE5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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