Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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