Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms