Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps4Q99KG7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms