Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms