Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms