Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cchcr1Q8K2I2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cchcr1Q8K2I2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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