Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms