Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm28Q8CGC6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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