Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21aQ8C0S4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms