Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms