Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms