Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tspan12Q8BKT6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms