Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms