Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smarcal1Q8BJL0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smarcal1Q8BJL0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Smarcal1Q8BJL0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Smarcal1Q8BJL0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Smarcal1Q8BJL0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Smarcal1Q8BJL0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smarcal1Q8BJL0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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