Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms