Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Actn1Q7TPR4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms