Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trappc6aQ78XR0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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