Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms