Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms