Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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