Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms