Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt40Q6IFX3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Krt40Q6IFX3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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