Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg9aQ68FE2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Atg9aQ68FE2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Atg9aQ68FE2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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