Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms