Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms