Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

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Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpm3Q5F4S9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpm3Q5F4S9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpm3Q5F4S9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpm3Q5F4S9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpm3Q5F4S9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm3Q5F4S9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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