Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc3lQ4KL14 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms