Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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