Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms