Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmem253Q3UNB8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmem253Q3UNB8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmem253Q3UNB8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem253Q3UNB8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem253Q3UNB8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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