Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms