Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ssbp4Q3U4B1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms