Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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