Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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