Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Usp39Q3TIX9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp39Q3TIX9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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