Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pde12Q3TIU4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms