Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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