Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms